Masjid ini diklaim sebagai salah satu masjid pintar. Di masjid ini para pengunjung bisa berinternet ria tanpa batas. Selain itu, seluruh kelistrikan masjid menggunakan sumber listrik yang berasal dari tenaga matahari (solar panel), jadi selain berbasis IT, masjid in juga ramah lingkungan
Bahkan, masjid ini memiliki pula fasilitas untuk mengakses Alquran elektronik. Hal lain yang membedakannya dengan sejumlah masjid besar di Indonesia dan negara-negara lain, pengelola Masjid Kristal tak melarang para pengunjung untuk mengabadikan setiap sudut lokasi masjid. Para pengunjung juga dapat menikmati fasilitas wisata di sekitar masjid, yakni dengan menaiki perahu yang berkeliling di sekitar sungai.