Masjid Batu baru mulai difungsikan sebagai tempat untuk shalat Jumat sejak tahun 1348 H (1929 M). Arsiteknya didatangkan sendiri oleh Haji Haruna dari Pontianak. Namanya ialah Abdul Wahid bin Abu alias Wak Bangkik. Sang juru rancang telah sarat pengalaman dalam mengerjakan bangunan-bangunan umum.
Salah satu karyanya adalah memebangun Lembaga Pemasyarakatan Pontianak yang berada di Sungai Jawi. Hanya pada saat ini. Kompleks tersebut telah dihancurkan. Di atas lahannya, berdirilah Rumah Sakit Antonius.
Sejak didirikannya hingga sekarang, Masjid Batu tetap berfungsi sebagai tempat menimba ilmu-ilmu agama. Semasa Haji Ismail masih hidup, majelis taklim yang dipimpinnya di sana ialah berkaitan dengan ilmu-ilmu akidah, akhlak, dan syariat.Demikian pula perayaan Maulid Nabi dan Isra' Mi'raj tetap dilaksanakan secara rutin.
Tuan Guru Ismail meninggal pada Kamis, 15 Jumadil Akhir 1376 H/16 Januari 1957 M.Hingga saat ini, makamnya kerap dikunjungi para peziarah dari berbagai daerah.